La mission de l'IUT est de former des cadres et des techniciens supérieurs dans les domaines scientifiques, économiques et commerciaux. La formation est sanctionnée par un diplôme national : le Diplôme Universitaire de Technologie (DUT). Elle est assurée par des enseignants-chercheurs, des chercheurs, des enseignants des différents corps de l'éducation nationale et des professionnels vacataires. La durée normale des études est de deux ans. Le cursus peut être aménagé pour les sportif de haut de niveau.
L'enseignement est assuré au sein de Départements d'études, chaque Département correspond à une spécialité. Il existe actuellement 24 spécialités en France, dont 10 sont enseignées à l'IUT de Dijon-Auxerre et réparties sur les sites de Dijon et d’Auxerre.
L'IUT de Dijon-Auxerre a ouvert ses portes en octobre 1968 avec quatre Départements, correspondant chacun à une spécialité de DUT :
Biologie Appliquée, devenu Génie Biologique
Carrières de l'Information, devenu Information Communication
Génie Mécanique, devenu Génie Mécanique et Productique
Gestion des Entreprises et des Administrations
Au fil du temps, l'offre de formation s'est renforcée, sur le site de Dijon pour commencer puis sur les sites d'Auxerre et de Nevers pour compter à l'heure actuelle dix spécialités de DUT et 11 licences professionnelles.
L'IUT de Dijon-Auxerre en quelques chiffres :
7 Départements sur le site de Dijon et 4 sur celui d'Auxerre
7 licences professionnelles sur le site de Dijon et 4 sur celui d'Auxerre